Ich habe am Standard-Linuxclient (Ubuntu 16.04) auf den Kernel 4.4.0-87 upgedatet, was zur Folge hatte, dass mit einer Domänenanmeldung auf dem Server nicht wie seither eine Verbindung für den Domänenbenutzer angezeigt wurde (# smbstatus -b), sondern für jeden smb-mount eine (also mehrere). Damit sind aber Doppelanmeldungen nicht mehr so einfach zu erkennen.
Mit dem mittlerweile verfügbaren Kernel 4.4.0-89 ist das leider nicht anders und ich konnte in den log-Dateien auf dem Server und auf dem client auch keine Unterschiede zur Anmeldung unter dem alten Kernel finden. Auch sonst habe ich keinen Ansatz das Problem mit den neuen Kerneln zu lösen.
Ich habe daraufhin den installierten Kernel 4.4.0-83 auf hold gesetzt mit
# aptitude hold linux-generic linux-headers-generic linux-image-generic
Vielleicht findet jemand gelegentlich die Ursache für das Problem und eine Lösung, bis dahin hilft vielleicht der workaround einem anderen.