Hallo Guntram,
in /etc/linuxmuster/sophomorix/default-school/students.csv oder eben teachers.csv siehst Du ja alle angelegten User. Wer da nicht drin steht, ist nicht aktiv. Einzige Möglichkeit noch: der User ist in attic und noch in der toleration Range, die kannst Du unter
/etc/linuxmuster/sophomorix/default-school/school.conf
für jeden Nutzertyp einstellen. Dort einfach
TOLERATION_TIME=6
DEACTIVATION_TIME=6
auf jeweils 0 stellen bei S oder Lehrer, dann sophomorix-check, update, kill und so (hinterher ggf. wieder hochsetzen).
Dann sind sie wirklich weg. Magst Du gleichnamige Nutzer wieder anlegen, würden sie jedoch eine Ziffer hinter ihrem Namen bekommen, weil die LMN sich alle Nutzer merkt. Die stehen in der Datei
/var/log/sophomorix/userlog/user-add.log
und können dort gelöscht werden bei Bedarf, dann gibts keine Zahl hinter dem username 
LG
Max